研究人员发现与COVID-19重症风险显著增加相关的基因

发表于 4年以前 | 总阅读数：658 次

不列颠哥伦比亚大学心肺创新中心的博士后Ana Hernandez Cordero及其同事利用综合基因组学与蛋白质组学相结合来确定这些基因。

基因组研究确定了可能在生物过程中发挥作用的特定基因，如疾病的发展，而蛋白质组学也对蛋白质进行研究。研究人员可以通过整合工具来调查这两方面的情况，从而更全面地了解疾病过程。

Hernandez博士说："DNA是一个大的、复杂的分子，因此，仅靠遗传关联不能确定负责COVID-19的确切基因。然而，通过将COVID-19的遗传信息与基因表达和蛋白质组数据集相结合，我们可以弄清楚哪些基因在推动与COVID-19的关系。"

研究人员将遗传信息与肺部基因表达的检查结合起来，以确定控制肺部基因表达的遗传变异，这些变异是COVID-19的原因。研究人员确定了特定基因的标记，它们对基因表达和蛋白质水平的影响与COVID-19的易感性相同。为了进行分析，他们使用生物信息学来整合。

1）从感染SARS-CoV-2的病人以及非感染者（对照组）获得的基因组数据集；

2）来自临床人群（非COVID-19）的肺部和血液组织基因表达数据集；

3）从献血者（非COVID-19）获得的蛋白质组数据集。

他们发现，负责免疫系统对COVID-19反应的几个基因也参与了COVID-19的易感性，这得到了以前研究结果的支持。

在血液蛋白中寻找候选基因，他们能够更进一步将基因的影响与COVID-19的易感性联系起来。血液蛋白质组学还可以帮助确定血液中的标记物，这些标记物可以很容易地被测量，以表明疾病状态，并有可能监测疾病。

"通过利用基因组信息的力量，我们确定了与COVID-19有关的基因，特别是，我们发现ABO基因是COVID-19的一个重要风险因素。特别值得注意的是血型ABO和COVID-19风险之间的关系。我们表明，这种关系不仅仅是一种关联，而是因果关系。"

除了ABO基因，埃尔南德斯博士及其同事发现，携带SLC6A20、ERMP1、FCER1G和CA11某些基因变异的人感染COVID-19的风险明显更高。"这些人在大流行期间应该特别小心。这些基因也可能被证明是疾病的良好标记以及潜在的药物目标。"

在研究人员的分析中发现的几个基因已经与呼吸道疾病有关。例如，ERMP1已经与哮喘有关，CA11也可能使糖尿病患者的COVID-19风险升高。

使用综合基因组学（IG）将COVID-19的遗传关联与基因和蛋白表达结合起来。IG的目的是确定将遗传密码的影响与复杂疾病联系起来的机制（例如：基因表达水平）。这些方法虽然复杂，但也很快速，其结果可以帮助研究人员确定体外（实验室内）和体内（活体）测试的候选基因的优先次序。

埃尔南德斯博士补充说："自从我们第一次进行这项分析以来，我们的研究已经取得了进展。我们现在已经为COVID-19确定了更多有趣的候选基因，如IL10RB、IFNAR2和OAS1。这些基因已经与重症COVID-19有关。它们在对病毒感染的免疫反应中的作用和越来越多的证据表明，应该进一步研究这些候选基因和它们在COVID-19中的作用"。